Affymetrix(R) - GeneChip(R)Array |
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GeneChip(R)アレイは1枚のアレイに1サンプルをハイブリダイズするシングルカラー方式(1色法)です。同一アレイ上で比較サンプルを競合的にハイブリダイズする2色法以上に、1色法ではチップ間の再現性が大きな問題となります。GeneChip(R)アレイは、フォトリソグラフィーとコンビナトリアル・ケミストリーを組み合わせたオートメーション製造プロセスにより作製されています。この技術により、チップ間での発現比較を可能にする一定の品質が維持されており、再現性の高い解析が可能です。
また、GeneChip(R)アレイシステムでは、ハイブリダイゼーション以降の操作が自動化されているため、作業に由来するチップ間のデータのばらつきが最小限に抑えられ、高い再現性を得ることができます。
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BMRは2003年6月より、Affymetrix Japanの公認プロバイダとしてGeneChip(R)Array受託解析を行っています。3’Expression Array、Gene Array、Mapping／ SNP Arrayの他にもResequencing Arrayなど、多数のラインナップがあります。 |
FFPEサンプルからのGeneChip(R)3’Expression Array解析やデータマイニングのみの受託、RNA抽出からの解析も承ります。
遺伝子発現解析用のアレイです。
・必要サンプル量：
真核生物用…3' IVT Express Kit利用します。total RNA 300ng以上が必要です。
＊：1および2-Cycle法の試薬販売が2009年末で終了しました。
原核生物用…total RNA 30μg以上
FFPEサンプル用…total RNA 150ng以上
さらに微量の場合には、ご相談ください。
・Test アレイ：
キャンペーン価格適用時を除き、ヒト、マウス、ラットの場合には
標準でTest アレイによるシグナルチェックを行います。
・データマイニングサポートサービス：
GeneSpring GX（Agilent Technologies社）によるデータ解析を標準で行います。
データ解析結果はお客さまのお手元にてGeneSpring GXで閲覧いただきます。
従来の 3’Expression Array と異なり、転写産物全長からプローブをデザインしたアレイです。
・必要サンプル量：
total RNA 300ng以上 (rRNAの除去は必要ございません)
・データマイニングサポートサービス：
GeneSpring GX（Agilent Technologies社）によるデータ解析を標準で行います。
データ解析結果はお客さまのお手元にてGeneSpring GXで閲覧いただきます。
ヒトゲノムDNA（SNP）解析用のアレイです。
BMRでは、最新のSNP Array 6.0も受託可能です。
・必要サンプル量：
Mapping Array…ゲノムDNA 500ng以上
SNP Array…ゲノムDNA 1μg以上
さらに微量の場合には、ご相談ください。
・データマイニングサポートサービス：
Mapping Array：
Assosiation Studyや Linkage解析の場合に、GeneSpring GT（Agilent Technologies社）による
解析が可能です。
LOH解析やCGH解析の場合には、 Chromosome Copy Number Analysis Tool（Affymetrix社）による
データ解析を行います。
SNP Array：
データ解析については、別途お問い合せください。
 GeneChip(R) Tiling Array |
ゲノムDNA配列よりリピート配列を排除後、35bpの間隔で25merのプローブを配したアレイです。
クロマチン免疫沈降（ChIP）法および転写産物マッピング実験に応用可能な商品です。
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