GeneChip(R) Gene Array受託解析の流れ

1.サンプルを調製してください

●	解析に必要なtotal RNAはつぎのとおり

●	ｒRNAの除去は必要ございません。

●	サンプルの調製にはRNeasy(R) Mini Kit （QIAGEN(R)）などカラム精製式のキットを推奨します。

●	Invitrogen(TM) TRIzolなどで処理したサンプルの場合にも、有機溶媒を除去するためにRNeasy(R)などのカラム精製式のキットでクリーンアップしてください。

●	サンプル調製時に逆転写反応の阻害剤（硫酸化多糖類、EDTA、DEPCなど）が残存していますと、マイクロアレイ解析を行えない場合があります。

●	RNAサンプルはRNase-free水（DEPCも含まないもの）に溶解してください。Invitrogen(TM) Distilled Water（DNase/RNase Free）を推奨します。

●	RNA抽出サービスをご利用の場合はこちら＜RNA抽出サービスをご覧ください。＞

2.サンプルを送付してください

●	依頼書を1）サンプルに同梱、もしくは2）Eメールに添付、3）FAXにて送付してください。依頼書のダウンロードはこちら

●	土日祝祭日はサンプルの受け取りができませんので、平日の9時から18時に弊社着となりますように、冷凍（ドライアイス同梱）にてお送りください。

●	送付先〒270-0101　千葉県流山市東深井105 株式会社バイオマトリックス研究所 BMR技術開発センター　マイクロアレイ事業部 TEL：04-7178-5118／FAX：04-7178-5119 Eメール：support@biomatrix.co.jp

3.サンプルクオリティチェックを行います

●	Bioanalyzer（電気泳動装置）及び、NanoDrop（分光光度計）にて、送付いただいたRNAの品質をチェックします。この時点で基準に満たない場合にはサンプルを再調製・再送付いただく場合があります。

4.cRNA、ssDNAクオリティチェックを行います

●	3.のクオリティチェックを通過したサンプルからcRNA、続いてssDNAを合成し、それぞれNanoDrop （分光光度計）にて十分な量・品質のcRNA、ssDNAが合成されたことを確認します。

5.遺伝子発現解析を行います

●	ご指定のGeneChip(R) Gene ArrayにssDNAをハイブリダイズさせ、シグナルを検出します。

6.データマイニングを行います

●	GeneSpring GXなどを用いたデータ解析を行います。データマイニングの詳細はこちら

7.お返しするデータ

報告書類

・	実験報告書	（PDFおよび印刷物）
・	データマイニングサポートサービス報告書	（PDFおよび印刷物）

データファイルおよびソフトウエア

・	GeneSpring GX関連
	GeneSpring GXインストーラ
	Projectデータ	（GeneSpring形式）
	弊社にて解析に使用したGeneSpring用のファイルです。
	Entity List	（エクセルファイル）
	GeneSpring GXにて処理をおこなった比較毎のGene Level数値および　　　　アノテーションをエクセルファイルにまとめてあります。
・	Affymetrix(R)のソフトから出力されるデータ類
	CEL, CHP, DAT, JPGを含む　　　　Affymetrix(R) GeneChip(R) Command Console(R) Software(AGCC)および　　　　Affymetrix(R) Expression Console(TM) Software(EC)から　　　　出力されたRawデータ。

参考資料等

＊上記はデータマイニングサポートサービスご利用の場合です。
データ納品に利用するメディアはデータ量により異なります。

株式会社バイオマトリックス研究所はアフィメトリクス・ジャパン株式会社より認定された受託解析サービスプロバイダです。