図中の黒い部分は、合成された配列である未修飾のマイクロアレイプローブ（黒）で、この部分が、ターゲットとなるmiRNA（赤）とハイブリダイゼーションにより結合します。プローブはスティルト（オリゴヌクレオチドで構成された足）（茶）によりガラススライド表面に固定されています。
A ： hybridization sequenceの5'末端にあるG残基（黒）は、miRNAの3'末端にラベリングにより導入されたC残基（黄）と相補的に結合します。このG-C対がプローブとターゲットの反応領域に加わることで、ターゲットとなるmiRNAが、他の相同なRNAよりもプローブに安定して結合します。また、すべてのプローブには、プローブとターゲットの反応領域に隣接して5'末端ヘアピン（青）が付加されており、miRNAのサイズに対する特異性を高めています。
B : 安定性が高すぎるため最適化が必要なプローブでは、miRNAの5'末端から塩基配列を除去することで、プローブとターゲットの安定性を調節しています。 |
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