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データマイニング受託解析

データマイニングとは、大量のデータを統計的に処理し、特徴的なデータ構造を見つけてパターン化し、これらの関係性を発見することです。

マイクロアレイ実験においても大量のシグナルデータを統計的に解析して遺伝子発現変動を知り、さらに生物学的意味を解釈しなければなりません。マイクロアレイ実験で得られるシグナルデータは、画像解析ソフトにより各プローブの蛍光をスキャンし、シグナル強度を数値化したものです。

常に生物学的意味を損なわないように注意しながら、シグナルデータの統計処理を行い、有意な遺伝子発現変動を見つけ出す必要があります。また、生物学的情報とアレイ解析結果の関連付けを行い、生物学的解釈をサポートします。

データマイニングで有意な結果を導き出すためには、マイニングをするのに十分な情報が必要です。なかでも反復実験が重要で、反復がないと信頼性のあるマイニングを行うことができません。

データマイニングを効率的に行うために、多くのマイクロアレイデータ解析ソフトが開発されています。なかでもAgilent社のGeneSpring GXは世界で広く利用されており、解析データを解釈しやすい形で出力することが可能です。また、遺伝子発現情報の統計的解析だけでなく、Pathway解析機能や遺伝子に対する豊富なアノテーション提示機能を有しています。弊社サービスでは、「弊社技術者がGeneSpring GXにて処理したデータ」と「お客様用のGeneSpring GXのライセンス(1か月分)」をご準備します。お客様には、十分な後術サポートを通じ、最新のGeneSpring GXの機能をご利用いただけます。



データマイニングサポートサービス

従来のマイクロアレイ受託解析においては解析後のシグナルデータ(生データ)をお返しするサービスしかありませんでした。このような受託サービスでは、マイクロアレイ解析結果を最大限に活用していただけないと考え、弊社ではマイクロアレイ受託解析を補完するために標準でデータマイニングサポートサービスを行っております。

解析結果は弊社技術者があらかじめ処理を行ったデータをGeneSpring GX上で活用いただくことで、生物学的意味の解釈に集中いただけるような環境にてご報告させていただきます。

事前にご要望をいただいた場合にはご希望に沿った最適な解析を行い、特にご指定のない場合には弊社のデフォルトの方法(ノーマライゼーションを行い、2倍以上もしくは1/2以下に変動した遺伝子の絞込み等)にて解析いたします。

データマイニングサポートサービスの流れ〜RNAサンプルをお送り頂いた場合〜


データマイニングサポートサービスのみでも承ります。

本サービスでは、お手持ちのマイクロアレイデータの解析をサポートさせていただきます。お客様と弊社技術者が一連の解析を通じて十分なやり取りを行うことで、詳細な目的に応じたデータ解析結果を提供させていただきます。

データマイニングサポートサービスの流れ〜お手持ちのデータをお送り頂いた場合〜


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データマイニング例 (マウスES細胞の分化誘導実験)のページへ

データマイニング例 (マウスフレンド白血病細胞の分化誘導実験)のページへ


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